В 1496 году начались преследования и в Португалии, церковь требовала от евреев перейти в христианство. Новых христиан стали называть Кристас Новос. Вскоре Кристас Новос стали эмигрировать в Кабо Верде, чтобы спастись от инквизиции и преследований со стороны христиан, следящих за «подлинностью» их новой веры. После прибытия первых евреев в Кабо Верде была основана столица Кабо Верде город Ривьера Гранде. С тех пор евреи стали играть значительную роль в развитии таких важных отраслей на Кабо Верде, как выращивание сахарного тростника, торговля шерстью и промышленными товарами. Для «новых христиан» была характерна христианская культура в целом, они старались вести себя так, как и основная часть населения – выходцы из Португалии. В экономическом же смысле создался особый «еврейский» торгово-промышленный слой. Многие евреи в этот период возвращались к иудаизму, однако в связи с преследованиями власти к началу 1700-х годов они были вынуждены порвать с иудаизмом в какой бы то ни было форме.
В 1800-х годах Кабо Верде становится средоточием угольнодобывающей промышленности. Многие американские и европейские кампании начинают исследования с целью эксплуатации месторождений Кабо Верде. Среди промышленников, прибывающих на Кабо Верде, были и евреи, которые, однако, были вынуждены, поселившись в стране, довольствоваться положением граждан «второго сорта» в исламской Северной Африке. Небольшая община евреев из Марокко закрепилась на Кабо Верде, основав колонии на островах Сантьяго, Сант-Виченце и Сант-Антао. В последующее время члены общины постепенно покидали территорию Кабо Верде, окончательно переселившись в Израиль во второй половине ХХ века.
В 1995 году несколькими десятками евреев в 1995 году было основано Кабо-вердийское общество дружбы с Израилем. В рамках деятельности этого общества проходит изучение еврейской культуры и истории, развивается программа описания еврейских кладбищ на островах, памятников еврейской архитектуры и искусства.